Deniz Harp Okulu’ndan mezun olduktan sonra çeşitli savaş gemilerinde görev yapmıştır. TCG Turgutreis(F-241) Komutanlığını Deruhte etmiştir. Burak sınıfı korvetlerin komodoru oldu. Genelkurmay karargahında istihbarat görevlerinde çalıştıktan sonra İtalya’da Roma Deniz Ataşeliği görevini deruhte etmiştir. Yurt dışı görevinden sonra Deniz Kuvvetleri İstihbarat Daire Başkanlığı görevine getirilmiştir.
2005 yılında Tuğamiralliğe terfi etmiş, Genelkurmay İstihbarat Daire Başkanlığı görevine getirilmiştir. İki yıl bu görevde kaldıktan sonra 2007-2009 yılları arası Mersin’de Akdeniz Bölge ve Garnizon Komutanı olarak görev almıştır.
2009 yılında Tümamiralliğe terfi ederek Deniz Kuvvetleri Komutanlığı Lojistik Daire Başkanlığı’na atanmıştır
Deniz Kuvvetleri Komutanlığı Lojistik Başkanlığı görevini yürütürken 11 Şubat 2011 tarihinde Balyoz davası nedeniyle tutuklanmıştır. Hasdal Askeri Cezaevi’ne nakledilen Polat, 2013 yılında Ağustos ayında yapılan YAŞ kararıyla emekliye sevk edilmiştir. Balyoz davasını yürüten özel yetkili Onuncu Ağır Ceza Mahkemesi tarafından 18 yıl hapis cezasına mahkûm edilmiştir.
19 Haziran 2014’te Anayasa Mahkemesi’nin Balyoz davasında hak ihlali yapıldığına yönelik oy birliğiyle aldığı karar neticesinde tahliyesine karar verildi. Yeniden görülmesine karar verilen davanın Dördüncü Ağır Ceza Mahkemesi tarafından 31 Mart 2015 tarihli kararıyla tüm sanıklarla beraber beraat etti.